关于举办高性能计算平台使用及GROMACS分子动力学模拟培训的通知

浏览次数:13发布者:肖春水


各位老师、同学:


为帮助新用户尽快掌握高性能计算平台的使用方法,提升专业软件应用能力,平台将于10月、11月分两期举办专题培训。现将有关事项通知如下:


一、培训安排总览

期次


时间

主题

主讲

形式


第一期

10月28日(周三)下午2:30

高性能计算平台基础操作介绍

平台管理员

线下+线上


第二期

11月10日(周二)下午2:30

GROMACS分子动力学模拟:安装、使用与建模

特邀专家

线下+线上


二、培训内容

第一期:平台基础操作介绍(平台管理员主讲)

1、平台总体架构与资源配置介绍

2、账号申请、登录方式、课题组功能

3、队列与资源查看

4、数据上传下载、作业状态监控

5、镜像创建与共享、环境配置与常用软件调用方式

6、平台使用规范、计费说明与常见问题答疑

7、科学计算与AI计算基本操作流程


第二期:GROMACS分子动力学模拟专题(特邀专家主讲)

1、GROMACS安装与部署

2、编译环境与依赖库准备

3、GPU加速版本(CUDA)配置要点

4、GROMACS基本使用

5、作业提交脚本编写与并行参数设置

6、常见命令与文件格式(.gro / .top / .mdp / .itp)讲解

7、结果分析常用工具(gmx energy / gmx rms / gmx hbond等)

8、分子建模实践:细胞膜/膜蛋白体系建模流程


三、培训对象

1、平台新注册用户、拟使用平台开展科研工作的教师与学生。

2、对分子动力学模拟感兴趣的其他师生。


四、其他事项

1、针对2026年新生和新进教工培训期间免费进平台试用欢迎新老用户积极参加,有技术问题可以会后交流。

2、建议参加第二期培训的师生具备基本的Linux操作基础。

3、培训资料及录屏将在培训后上传至信息技术中心网站,供大家学习。

4、线下培训地点:20幢5楼信息中心会议室,线上会议链接提前公布在【浙师大高性能计算用户服务官方群】。




信息技术中心

2026年10月21日